食品冻干机的组成结构主要是由干燥仓、真空系统、加热系统、水汽凝结器(冷阱)、控制系统等五部分组成。1、干燥仓：箱体采用不锈钢制造，箱体选用圆舱形结构，满足食品安全需求，便于清洗以保卫生和防腐。
2、真空系统：抽气迅速，能在很短时间内使干燥仓抽到预定的真空度，并能在生产过程中保持仓内真空。
3、加热系统：是对干燥箱内物料进行加热，以便使物料不断地得到升华热，使物品以达到规定的含水率要求，冻干机加热系统有不同的加热方法，在接触式加热中，我们采用的是循环介质加热法。
4、水汽凝结器(冷阱)：特殊设计的水汽凝结器(冷阱)在生产过程中通以低温的冷媒，使食品升华的水汽在盘管表面凝结成冰，水汽凝结器捕水分能力强，可连续工作，从而提高了整套设备的冷冻干燥能力。
5、控制系统（电气自动控制）：设备的制冷、真空、加热等系统统一控制可实现生产过程中的自动化管理，其真空度、温度等主要参数可随机检测，并可通过计算机编制各种冻干工艺曲线，以满足不同产品质量和技术要求。彩色显示器直观地监控设备运行；数据和曲线均自动打印。设备亦配备手动操作，便于调试。