乳酸菌是一类能利用可发酵碳水化合物产生大量乳酸的细菌的统称，大部分都是人体和动物内必不可少的、且具有重要生理功能的菌群，广泛存在于人体和动物的肠道中。在工业、农牧业、食品和医药等与人类生活密切相关的重要领域具有极高的应用价值。乳酸菌种在酸奶生产中是非常关键的物质，可以利用乳酸菌提高酿造和发酵食品，主要包括活性菌微生态制剂和发酵食品。乳酸菌经扩后浓缩分离得到菌体，经添加保护剂，冻干机冷冻干燥制成。
酸菌菌种冻干机工作原理是通过酸菌菌种在SFD冻干机低温冷冻，在真空环境下干燥处理得到菌种粉体。SFD冻干机包含物料仓体、冷凝仓体，制冷系统、加热系统、循环系统、真空系统、电控系统等组成。在PLC电控系统控制下酸菌菌种液体在物料仓进行低温冷冻结晶，结晶温度控制在-50℃左右，预冻时间3~5小时。控制结束达到要求后，进入一次干燥这一阶段进行干燥流离水，温度控制在10℃以下，干燥时间30~40小时左右，干燥控温速率和斜率在SFD冻干机工程师指导下进行。在一次干燥除水90%左右后进入解析干燥，这一阶段需要干燥除去结合水，干燥过程保证温度均匀性和稳定性，升温斜率按照SFD冻干机工程师指导数据控制。最后通过做压力升测试确定干燥结果，确保干燥水分达到标准。
在得到干燥效果无误情况下，关闭中隔阀，把物料仓和冷凝仓隔断，确保物料在无菌状态下取出酸菌菌种冻干粉。整个过程不允许有菌类污染。通过SFD冻干机冷冻干燥的酸菌菌种冻干粉活性高、速溶性好、耐抗生素、方便存储和运输。在国内外得到广泛应用。