对于冻干试剂来说，真空系统要求并不是很高，一般使用双级油旋片泵，基本上就可以满足要求，干式真空泵和罗茨泵是没必要的。第一，基本上IVD的设备都是比较小型；第二，真空泵油污染风险对IVD产品来说是极小；第三粉尘和水量都不足以对真空系统造成多大的伤害。而且真空泵的成本较低，哪怕备一台，出故障及时更换都是比较简单的。对于IVD产品对真空系统的要求，配套的辅助控制更为重要一些。
真空系统的指标和参数可以看之前箱阱的介绍。
对于真空系统的安全，阻断真空泵和设备的阀门，主要考虑应对：真空泵油乳化，真空下不来；停电或者停压缩空气。
一般配一个真空挡板阀即可。如果配气动阀门的，建议真空阻断阀配双作用的，防止压缩空气系统故障，在运行的时候没打开隔断阀门，IVD行业尽量少用大机器，上面这些问题就可以忽略了。
IVD产品重点是辅助系统：真空控制部分
没有真空控制的冻干机，很难做好IVD产品。主要原因是，一直抽极限真空，热传递中的对流传递会消失。对流消失分子运动传递能量变少，只有热传递和热辐射水分子很容易在内部累积，造成内部的真空不良，达到临界点就会塌陷。
真空控制方式
控制方式有两种：①开度调节；②掺气控制
①开度调节
开度调节对IVD来说，是很好的控制方式，但设备制造难度很成本是极高的，并且很难做好。原理：开度控制冷阱和箱体，使得箱体内的产品升华的水蒸气运动作为热传递媒介，增加对流，可以使得干燥层的温度和真空都都保持在安全线内。
②掺气控制
是最常用的方式，控制方式简单，成本较低，但对掺气的气体就需要有一定的要求。对于IVD产品来说，不建议直接掺入空气。空气中的成分对IVD试剂来说有些是有影响的，例如：氧气、二氧化碳、水汽，还有空气的温度。如果能掺入高纯氮气，是最好的选择。里面无水分子，可适当提高些真空度，提高升华效率。没有氧气，蛋白也不怕被氧化。如果没有高纯氮，或者研发使用频率很低，建议加一套空气处理系统：控制掺入空气的洁净度、湿度、二氧化碳、氧气等。
冻干终点判断
压升测试，是一个比较简单的判断方式，一般满载的压升是2分钟上升小于5Pa，不满载的情况，上升更小一些。对箱阱是泄漏率和极限真空有很高的要求，才能做压升测试。关于含水量的判断，国外设备上也有皮拉尼真空探头和薄膜硅真空探头的对比。原理：皮拉尼是通过气体的热运动换算出来的真空值，而薄膜硅是真空的压力值，理论上是可以作为判断依据的。如果有朋友在使用过，欢迎留言分享使用效果。