当药物表现出热塑性，并且对溶剂具有高亲和性时，会导致产品在干燥过程中产生困难。这是因为这类药物在遇到溶剂时，会变得非常易于溶化，从而使干燥过程变得异常复杂。
对于溶剂亲和性高的药物来说，在确定产品中的残余溶剂含量水平时，中小型喷雾干燥机需要更高的干燥温度或者更低的排气中溶剂蒸气含量。这一点尤其对于同时具有热塑性的产品来说是一个相当大的挑战，因为这限制了可用的干燥温度范围。
小型喷雾干燥机对于那些表现为热塑性并且具有较低转换温度的药物来说，有效的干燥温度范围是相当有限的。在干燥过程中，两个因素起到了决定性的作用：一方面，为了确保产品的稳定性以及防止粘结，干燥温度必须足够低；另一方面，为了能在物料液滴颗粒碰撞干燥塔壁以前进行有效干燥，干燥温度又必须足够高。更糟糕的是，物料中的溶剂表现得像一种增塑剂，降低了产品的允许温度。
离心喷雾干燥机错误的干燥条件可能会导致塔壁积料，从而导致获得率降低。过低和过高的干燥温度都可能导致这种结果。因此，对于中小型喷雾干燥机来说，区分干燥机进口温度、产品温度、干燥温度和干燥机出口温度是至关重要的。在一个设计良好的同流式中小型喷雾干燥机中，干燥温度和干燥机出口温度是相同的。然而，由于产品中溶剂的蒸发，产品温度会低于干燥机出口温度，通常为5～20℃。
在操作中小型喷雾干燥机时，必须充分考虑到这些因素，以确保获得的产品质量以及生产效率。
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