冷冻干燥机的3Q认证是用实验证明整套系统的设计符合试剂的质量要求，并以文件形式把过程数据真实记录下来，可以按照既定目标运行。一般包括设计验证，安装验证，运行验证和生产验证等。验证中要对设备进行测试，对整个过程进行验证。
用户在订购新的冻干机时应提出使用技术性能指标要求，包括冻干箱的板层面积，冷阱的凝冰量，冻干箱温度的要求的温度范围，冻干箱冷阱的最低温度，降温要求时间，冻干箱的极限真空和抽空时间，重要部件的制造厂商和型号，电气系统配置和控制方式，是否要小瓶压塞装置，是否需要CIP和SIP等等；并以文件形式提供给制造商。
01设计验证（DQ）
制造商根据用户的要求提供拟造冻干机的各项技术性能指标，并以文件形式提供给用户，用户验证拟造新机是否符合使用技术性能指标的各项要求。
02安装验证（IQ）
制造商根据合同和各种文件逐项对机器各部分进行检查、核对和记录，并对机器运转时达到的技术性能指标进行检查、核对和记录，以文件形式提供给用户。
03运行验证（OQ）
用户对设备的配置和各项技术性能指标进行逐项检查和核对，并进行运行检测，确认设备的各项配置符合文件（包括合同）的要求。并形成一个确认或验收文件。