真空冷冻干燥机开机后将物料投入物料箱内进行冷冻，物料的冷冻过程，一方面是真空系统进行抽真空把一部分水份带走；另一方面是物料受冻时把某些分子中所含水份排到物料的表面冻结，达到冷冻要求后，由加热系统对物料加热干燥，通过抽真空把物料中所含的水份带到冷冻捕集箱结冻，达到物料冷冻干燥要求。
真空冷冻干燥机技术原理：
冷冻干燥又叫真空冻结升华干燥，是将含水物料在低温下冻结，然后在真空条件下将水升华除去是使物料干燥的一门技术。
1、曲线OA为气化曲线，A为水的临界点P，t(bar，℃)，在OA曲线上水和水蒸气共存。
2、曲线OB为融解曲线，水和冰共存的状态。
3、曲线OC为升华曲线，冰和水蒸气共存的状态。
4、O点为上述三曲线的交点，叫水的三相点，其对应的压力温度为P，t(.5Pa，+0.℃)，此状态点水、水蒸气、水三相共存。
5、设有一盅水，如果将盅内的水在常温常压下自然蒸发，那么需要相当长的时间才能把盅内的水份蒸发掉，就是说水的气化速度很慢。
提高水分气化速度的方法有两种:
一、将水等压加热。即将水温升高并保持与大气压对应的饱和温度(即沸点℃)一致，这个状态就是过D点的等压线与气化曲线的交点E，水不停地沸腾气化。
二、将盅内的水放进一密闭容器里，启动真空泵对容器降压，当压力降到Pa，水开始沸腾，此时水的状态是过D点的垂直与气化曲线的交点F。若保证足够的真空度，使温度再降低，水的沸腾状态依然会继续下去。同理，在方法一中只要给水提供足够的热量保持沸点温度，沸腾状态也会继续下去，水分很快气化完毕。